• 109，109年度地層下陷防治專案服務計畫，研究人員。
• 110，地層下陷深層垂向變位機制探討及技術整合服務計畫，研究人員。
• 110，雲林中部地區地下水工業大用水戶抽水管理機制評估，研究人員。
• 110，110年度地層下陷防治專案服務計畫，研究人員。
• 111，量化深層垂向變位影響因子及技術整合服務計畫，協同主持人。
• 111，111年地層下陷防治推動計畫，研究人員。
• 112，水文地質參數受地層下陷影響之水力耦合變化推估驗證及技術整合計畫，協同主持人。
• 112，112年地層下陷防治推動計畫，研究人員。
• 113，彰雲地層下陷監測井井況評析及技術整合計畫，協同主持人。
• 113，113年地層下陷防治推動計畫，研究人員。

期刊論文

• Shih -Ching Wu, Kai-Yuan Ke, Hsien-Tsung Lin, Yih-Chi Tan. 2017. Optimization of Groundwater Quality Monitoring Network Using Risk Assessment and Geostatistic Approach. Water Resources Management, 31(1): 515-530. DOI: 10.1007/s11269-016-1545-x
• Hsien-Tsung Lin, Kai-Yuan Ke, Yih-Chi Tan, Shih-Ching Wu, Gao Hsu, Po-Chia Chen, Shi-Ting Fang. 2013. Estimating pumping rates and identifying potential recharge zones for groundwater management in multi-aquifers system. Water Resour Management 27(9): 3293–3306. DOI 10.1007/s11269-013-0347-7 (Impact Factor: 2.054, Water Resource Rank: 13/78)
• Shih-Ching Wu, Yih-Chi Tan, Chu-Hui Chen, Hsien-Tsung Lin. 2012. Estimation of effective hydrogeological parameters by considering varying heterogeneity and pumping rates. Environmental earth sciences 68:169-180. DOI: 10.1007/s12665-012-1727-7 (Impact Factor: 1.059, Water Resource Rank: 42/78)
• Hsien-Tsung Lin, Yih-Chi Tan, Chu-Hui Chen, Hwa-Lung Yu, Shih-Ching Wu, Kai-Yuan Ke. 2010. Estimation of effective hydrogeological parameters in heterogeneous and anisotropic aquifers. Journal of Hydrology 389:57-68 (Impact Factor: 2.656, Engineering Civil Rank:5/118)
• Hsien‐Tsung Lin, Kai‐Yuan Ke, Chu‐Hui Chen, Shih‐Ching Wu, Yih‐Chi Tan. 2010. Estimating anisotropic aquifer parameters by artificial neural networks. Hydrological Processes 24: 3237–3250. DOI: 10.1002/hyp.7750 (Impact Factor: 2.488, Water Resource Rank: 6/78)
• Shih‐Ching Wu, Yih‐Chi Tan, Chu‐Hui Chen, Shien‐Tsung Lin, Kai‐Yuan Ke. 2008. A two-dimensional inverse model to identify transmissivity in an anisotropic aquifer. Hydrological Processes 22:5086–5096. DOI: 10.1002/hyp.7134 (Impact Factor: 2.488, Water Resource Rank: 6/78)
• 吳詩晴、林賢宗、柯凱元、莊見財，2020，推導部分貫穿井於三維非等向含水層近似解析解之研究，農工學報，第六十六卷，第一期，DOI : 10.29974/JTAE.202003_66(1).0005。
• 吳詩晴、陳主惠、譚義績，2009，非等向含水層參數推估之研究，台灣水利，第五十七卷，第三期。
• 林賢宗、陳主惠、譚義績、吳詩晴、柯凱元，2009，利用禁忌演算法結合伴隨方法推估非法抽水井位置之研究，台灣水利，第五十七卷，第二期。
• 吳詩晴、林賢宗、陳主惠、譚義績，2007，反向推估地下水模式地下水文參數之研究，台灣水利，第五十五卷，第二期。

研討會論文

• Shih‐Ching Wu, Yih‐Chi Tan, Hsien‐Tsung Lin, Chu‐Hui Chen, Huang CC. 2010. Study of hydro-geological parameters in a heterogeneous and anisotropic aquifer. European Geosciences Union, Vienna, Austria. (Poster)
• Shih‐Ching Wu, Hsien‐Tsung Lin, Chu‐Hui Chen, Yih‐Chi Tan. 2006. Applying Tabu Search Method with Adjoint State Method on Estimating Hydrological Parameters. Western Pacific Geophysics Meeting, Beijing, China. (Poster)
• 謝其泰，郭俊志，吳詩晴，洪志宇，謝尚賢，2017，「臺灣災後復原重建案例研究之初探」，臺灣災害管理研討會。
• 吳詩晴、陳主惠、譚義績，2007，網格大小對推估地下水流參數影響之研究，水利研討會。
• 吳詩晴、林賢宗、陳主惠、譚義績，2006，探討伴隨狀態方法於逆推求未飽和之地下水文參數之應用，農業工程研討會。
• 游勝凱、陳主惠、譚義績、吳詩晴，2006，反向推求傾斜滲漏含水層地下水文參數之研究，農業工程研討會。
• 吳詩晴、譚義績，2004，由線型構造推判大屯山溫泉區溫泉分佈及地下水補注概況，農業工程研討會。

專書或技術報告

• 國科會，2020，防災手冊。
• 國科會，2019，防災手冊。
• 國科會，2019，104-107年度行政院災害防救應用科技方案成果總結報告。
• 行政院，2018，行政院災害防救科技創新服務方案_108-111年規劃書。
• 行政院，2018，民國107年災害防救白皮書。
• 國科會，2018，防災手冊。
• 吳詩晴，2012，異質性有效水文地質參數推估之研究，國立台灣大學生物環境系統工程博士論文。