• 108年~109年，智慧量水設備示範建置與其培力深耕計畫，主持人。
• 108年，台江國家公園棲地水文資料收集及調控規劃，主持人。
• 109年，台江國家公園生態多樣性棲地水土環境營造調控試驗示範計畫，主持人。
• 109年，109年度嘉義縣高速鐵路沿線鄉鎮市水井調查，主持人。
• 110年，台江國家公園四草濕地水域生態與水文調查暨水位營造試驗計畫(2/2)，主持人。
• 110年，110年度嘉義縣合法畜牧業納管水井推動作業，主持人。
• 111年，北汕尾水鳥保護區周緣圳路水文資料收集及水域生態調查計畫，主持人。
• 111年，111年度嘉義縣合法畜牧業納管水井推動作業，主持人。
• 112年，112年度嘉義縣合法畜牧業納管水井推動作業，主持人。
• 112年，112年度嘉義縣顯著下陷鄉鎮市水井調查，主持人。
• 112年，農田水利灌溉系統智慧灌溉設備設計監造作業，主持人。
• 112年，國立成功大學永續跨領域整合型計畫-海廢再生人工浮島生態環境營造之試驗研究，研究人員。

期刊論文

• Song, C. H., H. P. Huang, M. S. Chu, C. F. Ding, 2005, The strategies of land subsidence prevention in Taiwan, Proceeding of 7th International Symposium On Land Subsidence (SISOLS 2005), pp868-876, China.
• Leu, J. M., H. C. Chan, and M. S. Chu, 2008, Comparison of turbulent flow over solid and porous structures mounted on the bottom of a rectangular channel, Flow Measurement and Instrumentation, Vol. 19, pp331-337.
• 呂珍謀、朱木壽、陳厚元，2010，小波及灰色理論應用於地層下陷預警之研究-以濁水溪沖積扇為例，農業工程學報，第57卷，第1期。
• 黃煌煇、呂珍謀、朱木壽、宋長虹、蘇俊明，2010，非接觸式量測系統於河川流量觀測之應用，台灣水利季刊，第58卷，第3期。
• 宋長虹、朱木壽、劉俞佑、蘇俊明、黃俊仁，2010，複合式河川流量自動化觀測系統建構與應用，水利會訊，第13期。
• 林穎志、朱木壽、詹勳全、高昇敬、呂珍謀，2011，利用實測表面流速推估高流量之研究，中華水土保持學報，第42卷，第1期。
• 李宗仰、陳靜茹、朱木壽，2016，多時期衛星影像在耕地面積預測中之研究，上海國土資源，第37卷，第2期。
• 李宗仰、朱木壽，2016，QR碼與水井的親密接觸，科學發展，第528期。

研討會論文

• 宋長虹，黃煌煇，陳穎奇，朱木壽，1998，降雨對波浪減衰效應之影響，第二十屆海洋工程研討會論文集。
• 徐享崑，張國強，曾鈞敏，宋長虹，朱木壽，2000，「健全水權管理實施方案」推動成效及展望，跨世紀水資源管理研討會。
• Leu, J. M., C. J. Lai , M. S. Chu, 2002, Computation of bed deformation in an 180° bend using multi-layer turbulent models, Proceedings of the 5th International Conference on Hydrodynamics, pp221-226, Tainan, Taiwan.
• 丁崇峰、朱木壽、宋長虹、何建旺，2004，”地下水使用量推估方法之研究—以彰雲地區為例”，第十四屆水利工程研討會，國立交通大學，B35~B43。
• 朱木壽、黃煌煇、宋長虹、蘇俊明、黃俊仁，2009，非接觸式河川流量自動化觀測系統應用探討，第十八屆水利工程研討會，國立屏東科技大學，H75~H79。
• 朱木壽、詹勳全、黃國展，2011，實測表面流速推估高流量之研究，第15屆海峽兩岸水利科技交流研討會，中國武漢。
• 朱木壽、林政偉、陳建銘、龔明人、丁崇峰，2012，水權計量管理作業方式及地下水抽用量推估研究，第16屆海峽兩岸水利科技交流研討會，中國合肥。
• 朱木壽、李宗仰、李方中、鹿悌君、陳建銘、吳嘉恆、張順竹，2013，水井管理數位式標籤之應用研究，第17屆海峽兩岸水利科技交流研討會，台灣苗栗。
• 李方中、朱木壽、鹿悌君，2014，台南運河興衰探究，中國大運河水利遺產保護與利用戰略論壇，中國紹興。
• 朱木壽，林政偉，邱慶誠，陳建銘，邱南殼、吳嘉恆、廖垂麟，2014，灌溉水井抽水計量簡易方式之研究，第18屆海峽兩岸水利科技交流研討會，中國西安。
• 李宗仰，朱木壽，鹿悌君，2014，快速反應碼應用於行動化水井管理，第18屆海峽兩岸水利科技交流研討會，中國西安。
• 張廣智、吳嘉恆、林育如、朱木壽、陳建銘、邱慶誠，2015，雲彰地區既有水井申報納管推動實務，104年度農業工程研討會。
• 朱木壽，邱慶誠，林政偉，張廣智，吳嘉恆，林育如，2015，簡易量水設備追蹤水井抽水量動態資訊之研究，第19屆海峽兩岸水利科技交流研討會，中國上海。
• 林政偉、許時倫、朱木壽、顏弘政、蕭博元，2015，雲林地區公共給水抽取地下水之地層下陷影響分析，第32屆自來水研究發表會，中華民國自來水協會。
• Han-Lun Wu, Shih-Chun Hsiao, Yen-Lung Chen, Yu-Sheng Wu, Mu-Shou Chu,Chien-Ming Chen, Cheng-Wei Lin, 2015, Experimental study on development of dense fluid after solitary waves propagating over a submarine trench, 14th International Conference on Civil and Environmental Engineering, ICCEE 2015, Taoyuan, Taiwan.
• 李宗仰、朱木壽、鹿悌君、陳建銘、吳嘉恆、林育如，2016，條碼與定位在行動化水井管理之評估及應用，第20屆海峽兩岸水利科技交流研討會，台灣台北。

專書或技術報告

• 朱木壽，1993，多方式特徵法模擬變量流之穩定性分析，國立台灣大學碩士論文。
• 朱木壽，2010，渠道高流量非接觸式量測及其準確度之研究，國立成功大學水利及海洋工程研究所博士論文。

• 宋長虹、王南景、朱木壽，水災水位觀測系統(TW 094116872)，2005。
• 宋長虹、王南景、朱木壽，水位觀測裝置(TW 094207657)，2005。
• 王南景、宋長虹、王勝民、朱木壽、洪榮駿、黃國展、郭國泰，移動式水位監測裝置(TW 096205399)，2007。