水域環境下的土我們俗稱”底泥”，又稱底質沉積物主要由砂粒、黏土或其它物質混合並沉降在水體底層的軟質混合物。受侵蝕的土壤礦物及經分解的動植物碎屑等天然有機物或人為污染物，藉由風與水帶到溪流、河川、湖泊等至海域水體底部。底泥是許多種水棲生物之棲息地，同時也是持久性污染物的主要蓄積處。造成底泥污染的原因有很多，人為所製造的污染物飄到了地表水體上，有許多都包含有機性化合物(包含肥料或農藥等)、油污、與重金屬等。以上這些污染物質與泥沙吸附後沉降至水體環境中，受到污染的底泥乃為特定物質濃度上升，將連帶影響整個水域生態系，再者藉由食物鏈進而危害人體生活品質與衛生健康。 本所投入檢測國內計畫案中海域(河川)底質之研究工作，藉由歷年監測資料瞭解沉積物重金屬含量；並搭配底質粒徑分析及結合環境水體水質資料達區域水體概況，以達未來污染管制依據。